Что на самом деле внутри PSD-файла
PSD — не плоское изображение, а контейнер со слоями, масками, каналами и метаданными. Знание структуры объясняет поведение редактора.
PSD выглядит одним изображением, но это формат-контейнер: заголовок, блок цветового режима, ресурсы изображения, список записей слоёв и в конце сведённое составное превью. Каждая запись слоя хранит пиксели, маску, режим наложения, непрозрачность, группу, текстовые данные и векторные контуры. Открыть PSD — значит не загрузить картинку, а заново собрать множество частей. В редакторе PhotoPSD панель слоёв соответствует этим записям, а панель каналов — сохранённым каналам. Поскольку композит хранится отдельно, файл может выглядеть верно, даже если один слой не загрузился: вы видите превью, а редактируемый стек строится из записей.
Попробуйте со своим файлом
Откройте PSD со слоями и сравните панели с тем, что вы только что прочитали.